此外杂税尚多。在明代,大抵以税课司局收商税,三十取一。抽分场所科竹木柴薪、河泊所取渔课。又有市肆门摊税、塌房税、官设的货栈。契税等。明代此项杂税,大抵先简而后繁。随时随地,设立的名目很多,就《明史》也不能尽举。清代牙税契税,是通十八省都有的。此外,芦课、矿课、渔课、竹木税、牛马牲畜税等,则随地而设。都由地方官征收。
商业上,内地的通过税,明朝本来就有的。宣宗时,因钞法不通,于各水陆冲衢,专一设关收钞,谓之钞关。其初本说钞法流通之后,即行停止的,然此后遂沿袭不废,直到清朝,依然存在。清朝的关,有常关、海关之分。常关专收内地的通过税。有特派王大臣监督的,京师崇文门左右翼。有派户部司员监督的,直隶的张家口山西的杀虎口。有由将军兼管的,福州闽海关。有由织造兼管的。苏州浒墅关、杭州南北新关。各省钞关税,由督抚委道府监收。后来离海关较近之处,都归并洋关管理。洋关则各关都有税务司,其上又有总副税务司,都以洋人充之。由海关道监督。