《国朝献征录》（一称《献征录》）120卷，人物传记汇编。国史馆罢后，焦竑仍有志于国史撰述。这书是他搜集自洪武至嘉靖间朝野人物传记资料，编撰汇集而成。所记人物，按68门分类，征引皆注明出处，保存了丰富的明中期以前人物传记资料。从王世贞的《弇山堂别集》和焦竑的这两部书，大致可以看出明代史家在撰述本朝史过程中所做的一些基础性工作。这对后人治史是有启发的。
《玉堂丛语》8卷，是一部笔记体史料集，仿《世说新语》体例，记万历以前翰林人物言行。全书分行谊、文学、言语、政事、铨选、筹策等54门，书首有焦竑万历四十六年（1618）所撰小序《书玉堂丛语》，以及顾起元序和郭一鹗序。顾序概括了这书的性质、内容和特点，其文曰：“《玉堂丛语》若干卷……仿临川《世说》而记之者也。其官则自阁部元僚，而下逮于待诏应奉之冗徒。其人则自鼎甲馆选，而旁及于征辟荐举之遗贤。其事则自德行、政事、言语，而征摭于谐谑、排抵之卮言。其书则自金匮石室、典册高文，而博采于稗官野史之余论。义例精而权量审，闻见博而取舍严。词林一代得失之林，煌煌乎可考镜矣。”郭序称它“宛然成馆阁诸君子一小史然”。《玉堂丛语》是明代笔记中的上乘之作，保存了不少有意义的真实史料。[107]
